A、原子中质子带正电荷,电子带负电荷,原子不显电性是因为原子核所带电量与核外电子所带电量相等,电性相反,故A错;B、有机物中都含有碳元素,但含碳元素的物质不一定是有机物,例如一氧化碳、二氧化碳、碳酸盐等,故B错;C、构成物质的基本粒子有分子、原子、离子,分子可以构成物质,但物质不一定都由分子构成,故C正确;D、单质是由一种元素组成的纯净物,由一种元素组成的物质不一定是纯净物,故D错.故选C.