A、由于基因突变是碱基对的增添、缺失或替换，所以只有基因突变能产生新的基因，A错误；B、由于基因重组、基因突变和染色体变异都能导致遗传物质发生改变，所以都能产生可遗传的变异，B正确；C、基因突变和染色体变异产生的变异大都对生物体有害，C错误；D、只有染色体变异在显微镜下能看见，D错误．故选：B．
