这个要从几方面讲:首先明末的思想潮流是针对阳明学流弊所发,主要是纠偏。其结果就是开出了清代考据之学。几乎完全走向了阳明的反面。这个应该是黄宗羲他们自己都没想到的。
第二，比如刘宗周的弟子陈确(黄宗羲的师弟)，受曾静案的牵连，满门皆灭，学问著作都付之一炬，对后来的风气影响很大。
第三，黄宗羲为派遣自己的儿子以及门生黄百家，全祖望，万斯同等人入宫修纂明史，对清廷也做了不少妥协。
可以说清初三儒的思想在当时其实是引起强烈反响的，但学问的风气在当时已经转变，这是三儒也无法挽回的趋势。
三儒思想在清末民国时期，又由康有为，梁启超等人推广。其宋明儒学的理念为当时大儒如陈寅恪，熊十力等人接受。传到熊十力弟子牟宗三那里，又开到了新的高度。
时至如今，新儒家思想已成为当代中国一个重要的思想潮流。
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