本句语法没有问题。help的结构是help sb with sth,而what就做了介词with的宾语,是疑问句,疑问词what放在了句首而已。
I can help you with something. 这句话不是病句。将这句话变成特殊疑问句,就是what can I help you with? 所以不是病句。