blast你是不会命令还是怎么?
1.首先要把被对比的序列做成数据库
makeblastdb -in D:\blast\db\source\db.fasta -dbtype nucl -out D:\blast\db\source\db
其中D:\blast\db\source\db.fasta 是做成数据库文件的路径,D:\blast\db\source\db
是输出数据库文件的路径
2.然后再进行对比
blastn -query D:\blast\db\source.fasta -db D:\blast\db\source\db -out D:\blast\db\answer\answer.txt -evalue 0.00001
其中D:\blast\db\source.fasta是要进行对比的源文件的路径