刑事案件已经撤案受害者不同意撤怎么办

1、可以向检察机关提出，也可以向公安机关申请复议。
2、《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十条 人民法院、人民检察院或者公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案;认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的时候，不予立案，并且将不立案的原因通知控告人。控告人如果不服，可以申请复议。
第一百一十一条 人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的，或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察院提出的，人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。人民检察院认为公安机关不立案理由不能成立的，应当通知公安机关立案，公安机关接到通知后应当立案。
3、公安机关立案只是立案侦查，在侦查的过程中如果事实不清或证据不足，派出所就会停止侦查。公安机关的立案侦查是国家行为，而不是私人行为，并不是私人想调解就能了事的，私人不得干预。
对于自诉刑事案件，我国刑诉法第一百七十二条规定“可以进行调解，自诉人在宣告判决前，可以同被告人自行和解或者撤回自诉。”但如果是“被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件”则不适用调解。
而对于公诉案件，撤案的决定权在公安机关和检察机关手上，受害人可以就刑事附带民事部分接受调解。