柑橘黑星病的无性阶段为属半知菌亚门茎点霉属真菌。分生孢子器近球形，黑色，炭质，大小为120～350μm×85～190μm，具孔口。分生孢子梗长形，顶端细，无色，单胞。分生孢子单胞，无色，有两种形状：一种为椭圆形或卵形，尾端有一无色、胶质状的纤丝，大小为7～12μm×5.3～7μm；另一种为短杆状，两端略膨大，大小为6～8.5μm×1.8～2.5μm。两种孢子分别着生于不同的分生孢子器内。有性阶段为属子囊菌亚门真菌。子囊壳球形或扁球形，黑色，有孔口突出或不突出，大小139.4μm×128.1μm。子囊圆柱形或棍棒状，大小117.4μm×14.9μm。束状排列，拟侧丝早期消失。子囊内有8个子囊孢子，单列或双列。子囊孢子纺锤形，无色，初单细胞，成熟后为大小不等两细胞，大小15.3μm×6.7μm。
1.分生孢子器2.产孢细胞3.分生孢子
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